Questa zona umida carsica è l'unico stagno permanente dell’Arcipelago Toscano che ospita vegetazione flottante con Ranuncolo d'acqua. (Ranunculus peltatus subgen. Batrachium). del Parco è quella. Intorno a questo piccolo specchio d’acqua si sviluppa un mosaico  piccole piante: la vegetazione acquatica flottante e radicante con  il Ranuncolo e il Millefoglie (Myriophyllum alterniflorum) considerato specie Vulnerabile nella Lista Rossa Regionale..

Queste cenosi possono essere fitosociologicamente attribuite a syntaxa dell’ordine Potametalia pectinati.

Le Tife (Typha latifolia e Typha angustifolia) non erano presenti allo Stagnone fino al 1991, ora queste due specie si sono espanse in modo invasivo nello specchio d’acqua, diminuendo la superficie necessaria allo sviluppo delle piante acquatiche. Occorre limitare la presenza dalle Tife ed evitare così l’interramento del laghetto e la perdita  di specie rare e meritevoli di conservazione come la Brasca (Potamogeton crispus), la il Baldellia ranunculoides e il  Ranunculus peltatus  e di preservare un habitat di grande interesse per la sosta a Capraia l'avifauna migratrice.