L'Arcipelago Toscano è il regno dei rapaci delle coste. Qui nidifica il velocissimo Falco pellegrino e si può avvistare il Falco della Regina. Il rapace più comune è il Gheppio  che è spesso visibile nel blu del cielo, mentre fa lo "spirito santo", librato in un volo immobile e fremente  per individuare le prede. Tra i rapaci più grandi possiamo incontrare  la Poiana ed il Falco Pescatore, che è tornato a popolare le scogliere di Capraia. 

Segnalata più volte la presenza della rarissima Aquila del Bonelli e del Biancone, un rapace che si nutre solo di serpenti.

Le isole toscane sono soprattutto punto di sosta e di passaggio per molte specie di rapaci: l'Aquila minore, il Lodolaio, il Falco di palude, il Falco cuculo e il Grillaio,  che trovano nell' Arcipelago una serie di zattere per riposarsi durante le faticose migrazioni o gli spostamenti alla ricerca di nuovi areali.  I Rapaci  si trovano  al culmine della piramide alimentare e sono predatori di  una grande varietà di animali.    Il Falco pellegrino è un ornitofago (si nutre solo di uccelli), mentre altre specie predano rettili, piccoli uccelli, roditori, pesci, insetti e, nel caso delle Aquile,  anche animali  di maggiori dimensioni come conigli selvatici e lepri.

Le armi dei rapaci sono gli artigli , composti da dita lunghe e unghie affilate. Sulla pianta delle zampe sono presenti callosità molto sviluppate che consentono una più facile  presa sulle prede.

Il bracconaggio e la predazione delle uova,  che hanno ridotto per molti anni il numero di questi uccelli nell’Arcipelago Toscano, non sembrano più costituire un grave pericolo per la formazione di nuove colonie, mentre la presenza  delle linee elettriche rappresenta un problema comune per la maggior parte dei rapaci. L’impatto  contro i fili elettrici di linee a media e bassa tensione che attraversano il territorio ad altezze limitate, è una forte  causa di mortalità, perché queste  risultano spesso poco visibili per i rapaci in caccia a grande velocità.